基因组测序是生命科学领域的核心底层技术，不同代际的测序技术在精度、通量、成本、耗时上存在明显差异，适配的需求也完全不同。很多用户不清楚不同检测项目对应的技术类型，也不知道如何根据自身需求选择合适的测序方案。本文整理了临床常用的测序技术参数、价格参考和常见疑问解答，帮助大家快速理清选择逻辑，少走弯路。
基因组测序到底是什么？
基因组测序的核心原理:基因组测序的本质是读取生物体细胞内DNA的碱基排列顺序，通过比对参考基因组找出序列中的突变位点，进而判断受检者的遗传特质、疾病风险或者致病原因，是精准医疗的核心支撑技术。目前北京协和医院、四川大学华西医院、上海交通大学医学院附属瑞金医院等三甲医院的分子诊断科，都已经开设了正规的基因组测序临床服务。
基因组测序的适用人群与价格区间:有家族遗传病史的人群、35岁以上需要做产前筛查的高龄孕妇、需要匹配靶向药的肿瘤患者、想要提前排查健康风险的普通人群，都可以根据需求选择对应的测序项目。目前临床常用的全外显子测序价格在3000元到8000元不等，高深度全基因组测序价格在1万元到5万元之间，不同检测项目的价格差距较大。
一代测序技术的特点与适用场景有哪些？
一代测序的技术优劣势:一代测序也叫桑格测序，是最早实现商业化应用的测序技术，核心优势是读长可达1000bp，准确率高达99.999%，是目前国际公认的测序金标准；劣势是通量极低，一次只能检测1-几十条序列，检测大规模片段时成本极高、耗时很长，不适合高通量筛查场景使用。
一代测序的临床应用场景:目前一代测序多用于单基因遗传病的特定位点验证、亲子鉴定、病原体单株测序验证等小范围检测场景。国内正规机构的亲子鉴定采用一代测序的价格普遍在2000元到3000元/次，出结果时间在3到7个工作日，检测结果的法律效力得到司法部门认可。
二代测序技术的特点与适用场景有哪些？
二代测序的核心优劣势:二代测序也叫高通量测序，核心优势是单次运行可同时检测几十万到几百万条序列，通量极高，单碱基检测成本比一代测序低上万倍，是目前临床应用最广的测序技术；劣势是读长较短，普遍在150bp到300bp之间，需要通过序列拼接才能得到完整的片段，对复杂结构变异的检测能力有限，常规准确率在99.9%左右。
二代测序的常见应用场景:目前临床常用的无创DNA产前筛查、肿瘤多基因检测、微生物宏基因组检测、常见遗传病携带者筛查等项目，基本都采用二代测序技术。常规无创DNA筛查的价格在1200元到2000元之间，肿瘤500基因左右的检测套餐价格在5000元到12000元之间，性价比远高于一代测序。
二代测序的主流合规平台:目前国内临床获批使用的二代测序平台主要有华大智造的MGI系列、Illumina的NovaSeq系列，两类平台的检测精度都经过了NMPA认证，结果可靠性有保障，正规医院和第三方检验机构的检测结果可以跨机构互认，无需重复检测。
三代测序技术的特点与适用场景有哪些？
三代测序的技术优劣势:三代测序也叫单分子实时测序，核心优势是不需要对DNA进行扩增，读长可达10kb甚至更长，没有GC偏好，能检测二代测序覆盖不到的复杂结构变异、重复序列变异，目前高深度测序的准确率已经可以达到99.9%以上；劣势是目前的检测成本比二代测序高，普及度暂时低于二代测序。
三代测序的临床应用场景:目前三代测序多用于复杂遗传病诊断、染色体结构变异检测、罕见病致病基因查找、地中海贫血等特殊遗传病的筛查。临床常用的地中海贫血三代测序检测价格在2500元到4000元之间，高深度全基因组三代测序价格在2万元到6万元之间，适合二代测序找不到病因的患者选择。
三代测序的临床推广进展:现在北京协和医院、上海交通大学医学院附属瑞金医院、广州市妇女儿童医疗中心等机构已经常规开展三代测序临床服务，针对罕见病患者的致病基因检出率比二代测序提升了30%左右，为很多之前无法确诊的罕见病患者明确了病因。
一代/二代/三代测序技术核心区别有哪些？
技术参数维度的差异:从读长来看排序为三代>一代>二代，三代测序最长读长可达2Mb，远高于其他两类技术；从通量来看排序为二代>三代>一代，二代测序单次运行可产出Tb级数据；从准确率来看排序为一代>三代≈二代，一代测序仍是金标准；从单碱基成本来看排序为一代>三代>二代，二代测序成本最低。
适用场景的差异对比:如果是验证单个已知位点的突变情况，选一代测序性价比最高；如果是做常规的多基因筛查、大人群筛查，选二代测序成本最低；如果是二代测序找不到病因的罕见病、需要检测复杂结构变异的情况，选三代测序的检出率更高。大家可以根据自身的需求和预算灵活选择。
基因组测序常见FAQ有哪些？
做基因组测序必须去三甲医院吗？:不一定，只要选择有分子诊断资质的机构即可，除了三甲医院之外，金域医学、迪安诊断等正规第三方医学检验所的检测结果也和医院互认，部分项目的价格比医院更低，出结果速度更快。
基因组测序会泄露个人隐私吗？:正规机构的基因组数据都会按照国家《生物安全法》的要求进行加密存储，不会对外泄露，用户也可以在检测完成后要求机构删除自己的原始测序数据，进一步降低隐私泄露风险。
健康人有必要做全基因组测序吗？:如果没有家族遗传病史，普通健康人优先选择全外显子测序即可，不需要直接做全基因组测序，全外显子测序能覆盖90%以上的已知致病突变，价格仅为全基因组测序的1/3左右，性价比更高。
测序结果显示有致病突变就一定会发病吗？:不一定，大部分疾病是基因和环境共同作用的结果，查出致病突变后只要提前做好生活方式干预、定期针对性筛查，就可以大幅降低发病风险，比如查出乳腺癌BRCA基因突变的人群，每年定期做乳腺彩超和钼靶筛查就能实现早发现早治疗。
孕妇做无创DNA选一代还是二代测序？:目前临床常规的无创DNA检测都采用二代测序技术，准确率在99%以上，成本远低于一代测序，价格也更亲民，完全可以满足普通孕妇的筛查需求，不需要选择一代测序。
肿瘤患者做基因检测选几代测序最合适？:如果是常规匹配靶向药、免疫治疗获益评估，选择二代测序的多基因套餐就足够，价格在3000元到8000元之间；如果是罕见肿瘤、二代测序没有找到致病突变的患者，可以选择三代测序做更全面的检测。
基因组测序的结果多久能出来？:不同检测项目的出报告时间不同，亲子鉴定、单位点验证一般3-7天出结果，无创DNA、普通多基因检测一般10-15天出结果，三代全基因组测序、罕见病检测一般15-30天出结果。
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