体检时，许多肛管直肠疾病仅凭肛门直肠指检即可早期发现，因此进行健康体检时，应把它列为常规检查项目。体检中，通过肛门直肠指诊和便常规检查可能发现早期直肠癌，不应因身体轻微不适或麻烦放弃检查，失去诊断疾病的机会。
一般来讲，肛门直肠指检可分为肛外指检和肛内指检两部分。肛外指检的方法是：戴好手套后，用食指触及肛门周围有无硬结、肿物和压痛，有无波动感，并检查肛外皮下有无瘘管、索条走向等。而肛内指检即肛门直肠指检。检查方法是：在戴好手套或指套后，将食指伸入直肠内的检查。检查时，因医生突然用力将手指插入肛门内，括约肌可因受到刺激而痉挛，产生疼痛，尤其是当肛管有裂口或创面时，这时被检查者可张口呼吸以减少肛门的紧张度。
正常肛管有较好的收缩力和弹性，仅能伸入一手指。若肛门括约肌松弛，则失去弹性，可进2～3指，患者会出现排便失禁。通过直肠指检，几乎直肠下段8cm左右的长度均可触摸到。医生会认真地检查直肠前后左右壁有无压痛、包块及狭窄，并注意包块的大小、硬度、活动度。检查结束后，要检查指套有无血迹或黏液。注意血迹是鲜红色还是暗红色；黏液的颜色、性质、气味如何等，可作为诊断的参考。
如果患直肠癌的话，可以摸到肿块质地较硬，表面高低不平或呈菜花样，有脓液、坏死组织及暗红色的血液，并感觉肠腔狭窄，指套上也染有暗红色血液。在直肠指检时，除用于早期发现直肠肿瘤外，还可以检查下列疾病：1.直肠息肉：可触及质软且可推移的肿块，指套上常染血，色鲜红。2.内痔：内痔是柔软的静脉团，不易触及，但如有血栓形成，则可摸到光滑的硬结。3.肛瘘：可摸到索状物，有时在肛瘘内口可扪及小硬结。4.肛门直肠周围脓肿：如骨盆直肠间隙脓肿、直肠后间隙脓肿，在直肠内可摸到压痛性肿块。应该指出的是，光凭肛门直肠指检，不一定能完全确诊直肠癌，还要到有条件的医院里，做进一步的检查。
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