1.器械准备取出消毒好的窥镜和各种器械，用无菌盐水洗净窥镜上的消毒溶液。检查窥镜目镜和物镜是否清晰，调节镜灯高度，在镜鞘外面涂以灭菌甘油以利滑润。液体石蜡在盐水中会形成油珠，使视野不清，影响检查，不可使用。预先将输尿管导管插入输尿管插管窥镜备用。
2.插入膀胱镜男性病人在插膀胱镜前，探查尿道是否正常或有无狭窄，然后换用窥镜慢慢沿尿道前壁推至尿道膜部，遇有阻力时，可稍待片刻，等尿道括约肌松弛即能顺利进入膀胱。插入时切忌使用暴力，以免损伤尿道，形成假道。女性病人容易插入，但应注意窥镜不得插入过深，以免损伤膀胱。如所有为凹型镜鞘，需将膀胱镜旋转180°。
3.检查膀胱、输尿管插管窥镜插入膀胱后，将镜芯抽出，测定残余尿量。如尿液混浊（严重血尿、脓尿或乳糜尿），应反复冲洗至回液清晰后，换入检查窥镜。将生理盐水灌入膀胱，使其逐渐充盈，以不引起病人有膀胱胀感为度（一般约为300ml）。将窥镜缓慢向外抽出，看到膀胱颈缘为止。在膀胱颈缘的两下角处将窥镜推入2～3cm，即可看到输尿管间嵴。在时钟5点到7点的方位、输尿管间嵴的两端，可找到两侧输尿管口。如细心观察，可见管口有蠕动排尿、排血或排乳糜现象。最后，应系统、全面、由深至浅地检查全部膀胱，以免遗漏。
如需作输尿管插管，应调换输尿管插管窥镜，将4～6号输尿管导管插入输尿管口，直至肾盂，一般深达25～27cm。输尿管后端应做记号，以辨别左右。如输尿管口有炎症充血不能辨清时，可静脉注入靛胭脂溶液，利用输尿管口排蓝引导插管。
膀胱镜检查以及输尿管导管插完以后，将输尿管导管再插入膀胱一段，然后退出膀胱镜，用胶布将输尿管导管固定于外阴，以免脱出。膀胱内操作动作必须轻柔，检查时间不应超过30分钟。
4.尿液检查收集输尿管导管导出的尿作常规检查，必要时还可作细菌检查和培养。当由导管持续滴尿较快，如用注射器自导管吸尿，一次可吸出10～20ml以上时，应怀疑有肾盂积水。
5.肾功能检查如在膀胱镜检查中未作靛胭脂试验而又需作分侧肾功能检查时，应按规定剂量静脉注射酚红或靛胭脂，分别观察两侧肾盂导出的尿内出现颜色时间和浓缩时间。
6.逆行肾盂造影将输尿管导管连接注射器，注入造影剂进行肾盂造影，常用造影剂为12.5%碘化钠溶液，每侧注入5～10ml，注入应缓慢而不可用力，病人有腰痛时应立即停止并维持压力。
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